Dell’importanza del DNA mitocodriale per scoprire nuove specie.

[Alamanno Capecchi]

Procediamo con ordine.
Martedì 13 l’ amico Alberto Masi mi inviò una mail nella quale mi comunicava la notizia di un importante studio sulle variazioni genetiche del genere Ergaticus.

Per gli appassionati dello studio della sistematica e del processo di speciazione trascrivo quanto riportato in www.avibushistoriae.com/Periodi.htm “Cronologia 12”, un' enorme banca dati creata da Albero Masi, un lavoro gigantesco ed affidabile che non mi stancherò mai di consigliare agli interessati del settore


"Formazione di nuove specie nei Parulidae, Genere Ergaticus (Baird, 1865).
Le Foreste montane del Centro America sono Aree con una straordinaria biodiversità e che potenzialmente ospitano specie non ancora descritte dalla scienza. Un team internazionale di ricercatori del Museo Nacional de Ciencias Naturales, le Università del Messico e del Kansas hanno studiato le variazioni genetiche del genere Ergaticus (*), uccelli endemici che vivono nelle foreste di montagna dell'America Centrale tra i 2000 ei 3800 metri .
Ad oggi, solo due specie sono state riconosciute, la Ergaticus versicolor (Salvin,1864) e la Ergaticus ruber (Swainson, 1827).
Gli scienziati hanno esaminato la sequenza di 2370 paia di basi di DNA mitocondriale (mtDNA) da 81 individui appartenenti a questo Genere.
I risultati mostrano una struttura genetica più complessa di quattro lignaggi del DNA mitocondriale: Ergaticus versicolor (testa rosa), Ergaticus r. ruber (macchia bianca ), E. ruber (macchia bianca sulla guancia), E. r. r. melanauris (macchia grigia sulla guancia) e E. melanauris (macchia grigia sulla guancia) e E. rowleyi (l'intensità del rosso differisce leggermente da quella Ergaticus r. Rube r). E. r. r. melanauris può anche essere elevato a specie.
Questa diversificazione si spiega con il relativo isolamento delle popolazioni in diverse catene montuose separate da pianure.
La loro divergenza risale alla prima parte del Pleistocene.
Uno dei ricercatori che hanno partecipato allo studio, Borja Mila, ha dichiarato: " Questo studio conferma che gli uccelli del Centro America sono poco conosciuti filo-geograficamente. Ogni nuovo studio condotto in questa regione contribuisce alla scoperta di nuove specie permettendoci di capire meglio il processo di speciazione ".
L'esistenza di taxa geneticamente distinta è particolarmente preoccupante in termini di conservazione: i boschi di montagna dell'America Centrale (Messico e Guatemala) sono minacciati e l' habitat è molto frammentato.
PDF Speciation in an avian complex endemic to the mountains of Middle America (Ergaticus, Aves: Parulidae), qui
Nota:
(*) Ergaticus, forma latina del greco antico ergatikos "willing or able to work" ovvero, "disposti o in grado di lavorare"
Bibliografia:
- Jaeger, Edmund C. (1978). A Source-Book of Biological Names and Terms. p. 95.
- Baird, Spencer Fullerton (1865). Review of American Birds in the Museum of the Smithsonian Institution. Washington, D.C.: Smithsonian Institution. p. 264.
- Barrera-Guzmán, A. O., Milá, Borja, Sánchez-González, L. A., Navarro-Sigüenza, A. G (2012). Speciation in an avian complex endemic to the mountains of Middle America (Ergaticus, Aves: Parulidae). Molecular Phylogenetics and Evolution, 62: 907-920."
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[Alamanno Capecchi]

Ho riportato quanto scritto da Masi tutto in corsivo. Per una grafica più corretta e per leggere l’importante lavoro in PDF collegarsi al Sito.

[Simone Durigon]

Sono fermamente convinto che tutta la classificazione del regno animale, vada rivista attraverso l'analisi del dna mitocondriale.

Un lavoro simile è stato condotto dal Prof. Massa per cercare di capire meglio la filogenesi delle varie specie di Poicephalus e credo che si possa utilizzare anche per discriminare fra varie sottospecie, alcune delle quali dubbie e molto poco attendibili.

D'altronde attraverso questa tecnica si è anche scoperto che il Guarouba è molto strettamente imparentato all' Ara giacinto, mente il genere Agapornis risulta molto vicino al genere Loriculus distante sia geograficamente che morfologicamente.

La nomenclatura di molti generi sta cambiando grazie agli studi sul DNA.

[Pantaleo Rodà]

Sicuramente un'analisi genetica di questo tipo è molto più affidabile delle tecniche utilizzate in passato, basate principalmente su analogie fisiche e comportamentali, spesso però dovute più ad un evoluzione convergente che ad una reale parentela...credo che le sorprese, specialmente per le famiglie di uccelli meno studiate, saranno ancora molte...

[Alamanno Capecchi]

Per chiudere

Penso a quando le classificazioni si basavano, in prevalenza, sulle caratteristiche dei becchi e degli arti inferiori… penso… penso… ritorno al passato… ai bei tempi andati quando il frullar di ali nel cielo era veramente tanto.

“Arriva … e parte… Appena arriva comincia a cantare. La sua voce dolce e rotonda, si sente con piacere. Grandissimo è il numero che ne rimane in Toscana : non vi è bosco in monte o in piano, che in primavera ed in estate, non risuoni… di questo uccello. Nel… comincia a muoversi per emigrare : allora in alcuni anni se ne vede passare una quantità grandissima per la pianura Pisana. Nel Settembre del 1823, gli alberi dello stradone che da Pisa va al Parco Reale di S. Rossore, attraversando vastissime praterie, ne furono pieni per una diecina di giorni. Volavano … da una pianta all'altra, andavano a posarsi un poco sul prato, ritornavano sugli alberi, ma di là non si allontanavano, benché continuamente fossero molestati dai non pochi cacciatori che vi erano accorsi..”

Facile individuare l’uccello descritto, il nome dell’ornitologo e il titolo del libro.

[Alamanno Capecchi]

L’uccello descritto è il Cuculo.
L’ornitologo è Paolo Savi.
Il titolo del libro è “Ornitologia toscana”
Saluti e buone cove!!! a. c.

[Pantaleo Rodà]

Alamanno, ammetto di non essermi sforzato troppo...diciamo che quando ho letto "il suo canto" non immaginavo il CUCCU' di quest'uccello. Buone cove a tutti anche da parte mia! (non al cuculo però! ;))

[Alamanno Capecchi]

Alamanno, ammetto di non essermi sforzato troppo...diciamo che quando ho letto "il suo canto" non immaginavo il CUCCU' di quest'uccello. Buone cove a tutti anche da parte mia! (non al cuculo però! ;))


Giusta osservazione. Infatti il Savi scrive:”… non vi è bosco in monte o in piano, che in primavera ed in estate non risuoni del cu cu, cu cu di questo uccello”. Ho usato “canto” per deviare “l’indagine”. Una trappolina già usata nel precedente: - Quando lui si riproduceva in Toscana - .. Veniva facile pensare al libro del Savi, invece il pezzo era tratto da un libro di Michele Lessona.

[Alamanno Capecchi]

Per chi si interessa di sistematica.

Ecco, estratta, da - Birds of the World - di John J. Morony, Jr, Walter G. Bock, John Farrand Jr. , la Famiglia Fringillidae
Questa lista è utilizzata in Grzimek’ s, 2007 - Animal Life Encyclopedia - Uccelli parte IV pag.553, senza, però, la suddivisione in due sottofamiglie.



Fringillidae [Family]

Fringillinae

Fringilla [Genus]
F. coelebs [Species]
F. teydea
F. montifringilla

Carduelinae

Serinus [Genus]
S. pusillus [Species]
S. serinus
S. syriacus
S. canaria
S. citrinella
S. thibetanus
S. canicollis
S. nigriceps
S. citrinelloides
S. frontalis
S. capistratus
S. koliensis
S. scotops
S. leucopygius
S. atrogularis
S. citrinipectus
S. mozambicus
S. donaldsoni
S. flaviventris
S. sulphuratus
S. albogularis
S. gularis
S. mennelli
S. tristriatus
S. menschensis
S. striolatus
S. burtoni
S. rufobrunneus
S. leucopterus
S. totta
S. alario
S. estherae

Neospiza [Genus]
N. concolor [Species]

Linurgus [Genus]
L. olivaceus [Species]

Rhynchostruthus [Genus]
R. socotranus [Species]

Carduelis [Genus]
C. chloris [Species]
C. sinica
C. spinoides
C. ambigua
C. spinus
C. pinus
C. atriceps
C. spinescens
C. yarrellii
C. cucullata
C. crassirostris
C. magellanica
C. dominicensis
C. siemiradzkii
C. olivacea
C. notata
C. xanthogastra
C. atrata
C. uropygialis
C. barbata
C. tristis
C. psaltria
C. lawrencei
C. carduelis

Acanthis [Genus]
A. flammea [Species]
A. hornemanni
A. flavirostris
A. cannabina
A. yemenensis
A. johannis

Leucosticte [Genus]
L. nemoricola [Species]
L. brandti
L. arctoa

Callacanthis [Genus]
C. burtoni [Species]

Rhodopechys [Genus]
R. sanguinea [Species]
R. githaginea
R. mongolica
R. obsolete

Uragus [Genus]
U. sibiricus [Species]

Urocynchramus [Genus]
U. pylzowi [Species]

Carpodacus [Genus]
C. rubescens [Species]
C. nipalensis
C. erythrinus
C. purpureus
C. cassinii
C. mexicanus
C. pulcherrimus
C. eos
C. rhodochrous
C. vinaceus
C. edwardsii
C. synoicus
C. roseus
C. trifasciatus
C. rhodopeplus
C. thura
C. rhodochlamys
C. rubicilloides
C. rubicilla
C. puniceus
C. roborowskii

Chaunoproctus [Genus]
C. ferreorostris [Species]

Pinicola [Genus]
P. enucleator [Species]
P. subhimachalus

Haematospiza [Genus]
H. sipahi [Species]

Loxia [Genus]
L. pytyopsittacus [Species]
L. curvirostra
L. leucoptera

Pyrrhula [Genus]
P. nipalensis [Species]
P. leucogenys
P. aurantiaca
P. erythrocephala
P. erythaca
P. pyrrhula

Coccothraustes [Genus]
C. coccothraustes [Species]
C. migratorius
C. personatus
C. icterioides
C. affinis
C. melanozanthos
C. carnipes
C. vespertinus
C. abeillei

Pyrrhoplectes [Genus]
P. epauletta [Species]

[Alamanno Capecchi]

Ecco, estratta, da - Birds of the World - di John J. Morony, Jr, Walter G. Bock, John Farrand Jr. , la Famiglia Fringillidae.
Questa lista è utilizzata in Grzimek’s, 2007 - Animal Life Encyclopedia - Uccelli parte IV pag.553, senza, però, la suddivisione in due sottofamiglie.

Nella presentazione scritta in grassetto c’è una inesattezza voluta. La classificazione utilizzata nello Grzimeck non è identica a quella su riportata. Ad un certo punto, infatti, c’è un genere con nove specie, ma nell’originale sono tre. Le altre sei sono riunite in un altro genere.

Domandina.
Quale è il nome del genere non ritenuto valido?

[Alamanno Capecchi]

Aggiungo due osservazioni che possono aiutare ad individuare il genere omesso.

1) L’ unico genere della lista Fringillidae, qui riportata, che comprende nove specie, è il genere Coccothraustes.

2) Il Sibley, però, classifica i Frosoni in più generi. Se facciamo un confronto è facile “indovinare” quale può essere il genere omesso e nel quale Walter G. Bock aveva riunito le altre sei specie

[roberto ghidini]

Il Genus Acanthis non è più in uso,il venturone non è un Serinus ma un Carduelis,l Uragus e l Haematospiza andrebbero inseriti nei Carpodacus asiatici,e i frosoni non andrebbero inseriti tutti nei Coccothrautes,ma ci sono anche i Mycerobas e gli Eophona

[Alamanno Capecchi]

Il Genus Acanthis non è più in uso,il venturone non è un Serinus ma un Carduelis,l Uragus e l Haematospiza andrebbero inseriti nei Carpodacus asiatici,e i frosoni non andrebbero inseriti tutti nei Coccothrautes,ma ci sono anche i Mycerobas e gli Eophona


Non capisco, caro Roberto, la tua giusta osservazione, che esula, però, completamente dalla mia domanda.

[Alamanno Capecchi]

Rileggendo attentamente quanto scritto dall’amico Ghidini devo aggiungere che se le sue giuste osservazioni si riferiscono anche a generi non presenti nella mia domanda, vi risponde, comunque, indirettamente.

Domani chiarirò, per non generare fraintendimenti. Bravo Roberto!!! Alamanno

[Alamanno Capecchi]

Riporto quanto già scritto:” Ecco, estratta, da - Birds of the World - di John J. Morony, Jr, Walter G. Bock, John Farrand Jr. , la Famiglia Fringillidae.
Questa lista è utilizzata in Grzimek’s, 2007 - Animal Life Encyclopedia - Uccelli parte IV pag.553, senza, però, la suddivisione in due sottofamiglie.

Nella presentazione scritta in grassetto c’è una inesattezza voluta. La classificazione utilizzata nello Grzimeck non è identica a quella su riportata. Ad un certo punto, infatti, c’è un genere con nove specie, ma nell’originale sono tre. Le altre sei sono riunite in un altro genere.

Domandina.
Quale è il nome del genere non ritenuto valido?

La risposta è: Mycerobas

Questa è infatti la classificazione del BocK

Coccothraustes [Genus]
C. coccothraustes [Species]
C. migratorius
C. personatus

Mycerobas [Genus]
M. icterioides [Species]
M. affinis
M. melanozanthos
M. carnipes
M. vespertinus
M. abeillei

Procediamo con ordine. Tutto è iniziato quando mi è venuto in mente che in Grzimek’s, 2007 - Animal Life Encyclopedia – Uccelli - è stata utilizzata la classificazione:” - Birds of the World - di John J. Morony, Jr, Walter G. Bock, John Farrand Jr. del 1975.

E’ vero che gli autori sono pezzi da novanta nel campo dell’ ornitologia scientifica mondiale, ma è anche vero che gli studi sul DNA nucleare e il DNA mitocondriale hanno prodotto grossi punti interrogativi su classificazioni accettate e che sembravano collaudate.

Le ricerche vanno avanti ed io mi auguro che un giorno l’ornitologia e l’ornitocoltuira viaggino su ali in sintonia, con gli stessi diritti e identici riconoscimenti, e questo porterebbe sicuramente a reciproci vantaggi.

Per ricordare che, per ora, le acque sono ancora agitate riporterò, a breve, alcuni esempi.
Esempi brevi, pezzettini di classificazioni importanti; pezzettini, altrimenti la cartella “cultura” diverrebbe cartella tortura.

[Alamanno Capecchi]

Prendiamo come punto di riferimento il genere Coccostraustes e riportiamo alcune importanti classificazioni per confrontare le differenze.

J Peters, E Mayr ed altri.

COCCOTHRAUSTES
Coccothraustes coccothraustes (Hawfinch)

Coccothraustes migratorius (Black-tailed
Hawfinch)

Coccothraustes personatus (Masked
Hawfinch)


Coccothraustes icterioides (Black & Yellow
Grosbeak)

Coccothraustes affinis (Allied Grosbeak)

Coccothraustes melanozanthos (Spotted
wing Grosbeak)

Coccothraustes carnipes (White-winged Grosbeak)

Coccothraustes vespertinus (Evening Grosbeak)

Coccothraustes abeillei (Hooded Grosbeak)


Howard, Moore (concessionari) ed. 1980 e 1991


COCCOTHRAUSTES
Coccothraustes coccothraustes (Hawfinch)

Coccothraustes migratorius (Black-tailed
Hawfinch)

Coccothraustes personatus (Masked
Hawfinch)


Coccothraustes icterioides (Black & Yellow
Grosbeak)

Coccothraustes affinis (Allied Grosbeak)

Coccothraustes melanozanthos (Spotted
wing Grosbeak)

Coccothraustes carnipes (White-winged Grosbeak)

Coccothraustes vespertinus (Evening Grosbeak)

Coccothraustes abeillei (Hooded Grosbeak)


Christopher M. Perrins.


COCCOTHRAUSTES
Coccothraustes coccothraustes (Hawfinch)

Coccothraustes migratorius (Black-tailed
Hawfinch)

Coccothraustes personatus (Masked
Hawfinch)


Coccothraustes icterioides (Black & Yellow
Grosbeak)

Coccothraustes affinis (Allied Grosbeak)

Coccothraustes melanozanthos (Spotted
wing Grosbeak)

Coccothraustes carnipes (White-winged Grosbeak)

Coccothraustes vespertinus (Evening Grosbeak)

Coccothraustes abeillei (Hooded Grosbeak)


Zoonomen

Coccothraustes (m.) Brisson 1760 Orn. 1 p.36; 3 p.218 Systematics
• Coccothraustes coccothraustes (Linnaeus) 1758 Syst.Nat.ed.10 p.171
o Coccothraustes coccothraustes buvryi Cabanis 1862 J.Orn. 10 no.58 p.259,note
o Coccothraustes coccothraustes coccothraustes (Linnaeus) 1758 Syst.Nat.ed.10 p.171
o Coccothraustes coccothraustes humii Sharpe 1886 PZS Pt1 no.7 p.97
o Coccothraustes coccothraustes japonicus Temminck & Schlegel 1848 FaunaJap.Aves[Siebold] p.90 pl.51
o Coccothraustes coccothraustes nigricans Buturlin 1908 NaschaOchota no.9 p.7
o Coccothraustes coccothraustes schulpini Johansen,HC 1944 J.Orn. 92 Heft1&2 p.32
Eophona (f.) Gould 1851 BirdsAsia[Gould] 5 pt3 pl.18,text
• Eophona migratoria Hartert 1903 Vog.palaark.Fauna 1 p.59
o Eophona migratoria migratoria Hartert 1903 Vog.palaark.Fauna 1 p.59
o Eophona migratoria sowerbyi Riley 1915 Proc.Biol.Soc.Wash. 28 p.163
• Eophona personata (Temminck & Schlegel) 1848 FaunaJap.Aves[Siebold] p.91 pl.52
o Eophona personata magnirostris Hartert 1896 BBOC 5 p.38
o Eophona personata personata (Temminck & Schlegel) 1848 FaunaJap.Aves[Siebold] p.91 pl.52
Mycerobas (m.) Cabanis 1847 Arch.Naturgesch. 13 p.350
• Mycerobas icterioides (Vigors) 1831 PZS Pt1 no.1 p.8
• Mycerobas affinis (Blyth) 1855 J.Asiat.Soc.Bengal 24 no.2 p.179
• Mycerobas melanozanthos (Hodgson) 1836 As.Res. 19 p.150
• Mycerobas carnipes (Hodgson) 1836 As.Res. 19 p.151
o Mycerobas carnipes carnipes (Hodgson) 1836 As.Res. 19 p.151
o Mycerobas carnipes merzbacheri Schalow 1908 J.Orn. 56 p.204
o Mycerobas carnipes speculigerus (Brandt) 1841 Bull.Sci.Acad.Imp.Sci.St.Petersb. 9 no.1 col.11
Hesperiphona (f.) Bonaparte 1850 Compt.Rend. 31 p.424
• Hesperiphona vespertina (Cooper,W) 1825 Ann.Lyc.Nat.Hist.N.Y. 1 p.220
o Hesperiphona vespertina brooksi Grinnell 1917 Condor 19 p.20
o Hesperiphona vespertina montana Ridgway 1874 Hist.N.Am.Birds 1 p.449 pl.22 fig.4
o Hesperiphona vespertina vespertina (Cooper,W) 1825 Ann.Lyc.Nat.Hist.N.Y. 1 p.220
• Hesperiphona abeillei (Lesson) 1839 Rev.Zool. 2 p.41
o Hesperiphona abeillei abeillei (Lesson) 1839 Rev.Zool. 2 p.41
o Hesperiphona abeillei cobanensis Nelson 1928 Proc.Biol.Soc.Wash. 41 p.155
o Hesperiphona abeillei pallida Nelson 1928 Proc.Biol.Soc.Wash. 41 p.155
o Hesperiphona abeillei saturata Sutton & Burleigh 1939 Proc.Biol.Soc.Wash. 52 p.145
Pyrrhoplectes (m.) Hodgson 1844 Zool.Misc.[Gray,JE] 3 p.85
• Pyrrhoplectes epauletta (Hodgson) 1836 As.Res. 19 p.156


[B]Clements, James Franklin

Coccothraustes coccothraustes Hawfinch
Coccothraustes vespertinus Evening Grosbeak
Coccothraustes abeillei Hooded Grosbeak
Eophona migratoria Yellow-billed Grosbeak
Eophona personata Japanese Grosbeak
Mycerobas icterioides Black-and-yellow Grosbeak
Mycerobas affinis Collared Grosbeak
Mycerobas melanozanthos Spot-winged Grosbeak
Mycerobas carnipes White-winged Grosbeak
Pyrrhoplectes epauletta Gold-naped Finch

Sibley C. G. & Ahlquist J. E.

COCCOTHRAUSTES
C. coccothraustes (Frosone eurasiatico) PA, Ind

EOPHONIA
E. migratoria (Frosone codanera) PA
E. personata (Frosone mascherato) PA

MYCEROBAS
M. icterioides (Frosone giallo e nero) PA, Ind
M. affinis (Frosone dal collare) PA, Ind, Idc
M. melanozanthos (Frosone alimaculate) PA, Ind, Idc
M. carnipes (Frosone alibianche) PA, Ind, Idc

HESPERIPHONA
H. vespertina (Frosone vespertino) NA, CA
H. abeillei (Frosone dal cappuccio) CA

PYRRHOPLECTES
P. epauletta (Frosone nucadorata) Ind, Idc



FRANK GILL E M. WRIGHT - IOC WORLD BIRD LIST

Coccothraustes coccothraustes
Eophona migratoria
Eophona personata
Mycerobas icterioides
Mycerobas affinis
Mycerobas melanozanthos
Mycerobas carnipes
Hesperiphona vespertina
Hesperiphona abeillei
Pyrrhoplectes epauletta


La ricerca nella sistematica biologica pone ancora tanti punti interrogativi e suscita, tra gli studiosi non poche diversità di vedute.
Chiudo augurando a tutti voi, uova feconde, novelli da primo premio e Buona Pasqua !!!

[roberto ghidini]

La ricerca nella sistematica biologica pone ancora tanti punti interrogativi e suscita, tra gli studiosi non poche diversità di vedute.

Verissimo,speriamo che questa crisi finisca presto,e che ci siano al più presto i fondi per continuare il lavoro cominciato dall Università di Madrid